/

/

חיזוי מבנה המשני RNA באמצעות SHAPE תפוקה גבוהה

Journal JoVE
Biologie

Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu. Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.

Journal JoVE Biologie

RNA Secondary Structure Prediction Using High-throughput SHAPE

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

חיזוי מבנה המשני RNA באמצעות SHAPE תפוקה גבוהה

DOI:

10.3791/50243-v

•

13:42 min

•

May 31, 2013

•

Sabrina Lusvarghi*¹, Joanna Sztuba-Solinska*¹, Katarzyna J. Purzycka, Jason W. Rausch, Stuart F.J. Le Grice

¹RT Biochemistry Section, HIV Drug Resistance Program,Frederick National Laboratory for Cancer Research

Chapitres

00:05Titre
01:40RNA Folding
03:09Chemical Modification of the RNA
04:33Reverse Transcription
07:08Preparation of Sequencing Ladder and Capillary Electrophoresis
09:55ShapeFinder Software
11:15Data Normalization
11:51Results: RNA Structure Determination using RNA Structure Software
12:53Conclusion

Summary

Traduction automatique

acylation הידרוקסיל '2 סלקטיבית תפוקה גבוהה נותח על ידי הארכה תחל (SHAPE) מנצל כימי רומן חיטוט טכנולוגיה, שעתוק לאחור, אלקטרופורזה נימים ותוכנות לחיזוי מבנה משנית כדי לקבוע את המבנים של RNAs מכמה מאה עד כמה אלף נוקלאוטידים ברזולוציה נוקלאוטיד יחידה.

Tags

RNA Secondary Structure High-throughput SHAPE Chemical Probing Reverse Transcription Capillary Electrophoresis ShapeFinder RNAStructure In Silico Prediction Single Nucleotide Resolution

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

תפוקה גבוהה Overexpression פלסמיד שמרים מסך

פרוטוקול מבנה מחשב מבוסס חלבון חיזוי פונקציה

תפוקה גבוהה התגבשות של חלבונים בממברנה שימוש בשיטה Lipidic Bicelle

תפוקה גבוהה מיפוי פיזי של הכרומוזומים באמצעות אוטומטי<em> באתרו</em> הכלאה

הקרנה פונקציונלית תפוקה גבוהה באמצעות assay בלוציפראז Dual-זוהר תוצרת בית

מסך ידני מולקולה קטנה מתקרב תפוקה גבוהה באמצעות עוברי דג הזברה

קשירת יעילה ביותר של RNA קטן מולקולות לMicroRNA Quantitation על ידי רצף תפוקה גבוהה

הקרנת תפוקה גבוהה עבור כימית מאפננים של גני Post-תעתיק מוסדר

זיהוי של מטרות מירנה בתפוקה גבוהה באמצעות assay 3'LIFE

זיהוי של זוגות קינאז-מצע שימוש הקרנת תפוקה גבוהה

Read Article