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높은 처리량 SHAPE를 사용하여 RNA 이차 구조 예측
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RNA Secondary Structure Prediction Using High-throughput SHAPE
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높은 처리량 SHAPE를 사용하여 RNA 이차 구조 예측

DOI:
10.3791/50243-v

•

13:42 min

•

May 31, 2013

•

, , , ,
1RT Biochemistry Section, HIV Drug Resistance Program,Frederick National Laboratory for Cancer Research

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 01:40RNA Folding
  • 03:09Chemical Modification of the RNA
  • 04:33Reverse Transcription
  • 07:08Preparation of Sequencing Ladder and Capillary Electrophoresis
  • 09:55ShapeFinder Software
  • 11:15Data Normalization
  • 11:51Results: RNA Structure Determination using RNA Structure Software
  • 12:53Conclusion

Summary

Traduction automatique

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프라이머 확장 (SHAPE)에 의해 분석 높은 처리량의 선택 2 '수산기 실화는 단일 염기 해상도에서 수천 개의 뉴클레오티드로 수백에서의 RNA 구조를 결정하는 기술을 프로빙 소설 화학, 역전사, 모세관 전기 영동 및 이차 구조 예측 소프트웨어를 사용합니다.

Tags

RNA Secondary StructureHigh-throughput SHAPEChemical ProbingReverse TranscriptionCapillary ElectrophoresisShapeFinderRNAStructureIn Silico PredictionSingle Nucleotide Resolution

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