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Génération de haute qualité Immunoprécipitation de la chromatine Patron de l'ADN pour le séquençage à haut débit (ChIP-seq)
Journal JoVE
Biologie
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Journal JoVE Biologie
Generation of High Quality Chromatin Immunoprecipitation DNA Template for High-throughput Sequencing (ChIP-seq)
DOI:

09:52 min

April 19, 2013

, , ,

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 00:59Cross-linking Chromatin
  • 02:27Sonication
  • 04:14Pre-clearing Chromatin
  • 05:15Chromatin Immunoprecipitation
  • 07:10Reversing Cross-link and Purifying DNA
  • 08:12Results: Generation of a High Quality ChIP Template
  • 09:28Conclusion

Summary

Traduction automatique

La combinaison de l'immunoprécipitation de la chromatine et le séquençage ultra-haut débit (chip-seq) permet d'identifier et de cartographier les interactions protéine-ADN dans une lignée de tissu ou de cellule donné. Décrit est de savoir comment générer un modèle de puce de haute qualité pour le séquençage ultérieur, en utilisant l'expérience avec le facteur de transcription TCF7L2 comme un exemple.

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