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Détecter des altérations génétiques somatiques dans des échantillons de tumeurs par Exon et le séquençage massivement parallèle
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Detecting Somatic Genetic Alterations in Tumor Specimens by Exon Capture and Massively Parallel Sequencing
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Détecter des altérations génétiques somatiques dans des échantillons de tumeurs par Exon et le séquençage massivement parallèle

DOI:
10.3791/50710-v

•

11:02 min

•

October 18, 2013

•

, , , ,
1Department of Pathology,Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, 2Human Oncology and Pathogenesis Program,Memorial Sloan-Kettering Cancer Center

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 02:08Library Preparation: End Repair
  • 04:12Library Preparation: dA-Tailing and Adapter Ligation
  • 05:55Roche Nimblegen SeqCAP EZ Library Hybridization, Wash, and Amplification
  • 08:31Tumor-normal Pair Analysis
  • 10:08Conclusion

Summary

Traduction automatique

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Nous décrivons la préparation de banques d'ADN code-barres et ultérieure capture d'exon base hybridation pour la détection de mutations clés associés au cancer dans des échantillons de tumeurs cliniques par séquençage massivement parallèle "prochaine génération". Séquençage de l'exon ciblée offre les avantages d'un débit élevé, faible coût, et la couverture de séquence profond, donnant ainsi une grande sensibilité pour la détection de mutations de basse fréquence.

Tags

Somatic Genetic AlterationsTumor SpecimensExon CaptureMassively Parallel SequencingNext-generation SequencingCancer-associated MutationsSequence MutationsCopy Number AlterationsStructural RearrangementsTargeted Exon SequencingHigh ThroughputLow CostDeep Sequence CoverageHigh Sensitivity

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