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एक्सॉन कैद और व्यापक समानांतर अनुक्रमण द्वारा ट्यूमर नमूनों में दैहिक आनुवंशिक परिवर्तन का पता लगा

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Biologie

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Detecting Somatic Genetic Alterations in Tumor Specimens by Exon Capture and Massively Parallel Sequencing

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एक्सॉन कैद और व्यापक समानांतर अनुक्रमण द्वारा ट्यूमर नमूनों में दैहिक आनुवंशिक परिवर्तन का पता लगा

DOI:

10.3791/50710-v

•

11:02 min

•

October 18, 2013

•

Helen H Won, Sasinya N Scott, A. Rose Brannon, Ronak H Shah, Michael F Berger²

¹Department of Pathology,Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, ²Human Oncology and Pathogenesis Program,Memorial Sloan-Kettering Cancer Center

Chapitres

00:05Titre
02:08Library Preparation: End Repair
04:12Library Preparation: dA-Tailing and Adapter Ligation
05:55Roche Nimblegen SeqCAP EZ Library Hybridization, Wash, and Amplification
08:31Tumor-normal Pair Analysis
10:08Conclusion

Summary

Traduction automatique

हम बारकोड वाले डीएनए पुस्तकालयों और व्यापक समानांतर "अगली पीढ़ी" अनुक्रमण द्वारा नैदानिक ट्यूमर नमूनों में प्रमुख कैंसर से जुड़े म्यूटेशन का पता लगाने के लिए बाद में संकरण आधारित एक्सॉन कब्जा की तैयारी का वर्णन है. लक्षित एक्सॉन अनुक्रमण इस प्रकार कम आवृत्ति परिवर्तन का पता लगाने के लिए उच्च संवेदनशीलता उपज, उच्च throughput, कम लागत, और गहरी अनुक्रम कवरेज का लाभ प्रदान करता है.

Tags

Somatic Genetic Alterations Tumor Specimens Exon Capture Massively Parallel Sequencing Next-generation Sequencing Cancer-associated Mutations Sequence Mutations Copy Number Alterations Structural Rearrangements Targeted Exon Sequencing High Throughput Low Cost Deep Sequence Coverage High Sensitivity

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