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Von Voxel zu Wissen: ein praktischer Leitfaden für die Segmentierung der Elektronenmikroskopie Komplexe 3D-Daten
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Chapitres
- 00:05Titre
- 02:04Manual Abstracted Model Generation
- 04:47Manual Tracing of Features of Interest
- 08:10Automated Density-based Segmentation
- 09:15Custom-tailored Automated Segmentation
- 09:41Results: Application of Four Segmentation Approaches to Example Data Sets
- 11:29Conclusion
Der Engpass für Mobil 3D-Elektronenmikroskopie ist die Merkmalsextraktion (Segmentierung) in hochkomplexen 3D-Dichtekarten. Wir haben eine Reihe von Kriterien, die den Orientierungsrahmen in Bezug auf die Segmentierungsansatz (manuell, halbautomatisch oder automatisch) ist am besten geeignet für verschiedene Datentypen entwickelt, so dass ein Ausgangspunkt für eine effektive Segmentierung.
Tags
3D Electron MicroscopyUltrastructural OrganizationSegmentationVisualizationQuantificationResin Embedded Stained Electron TomographyFocused Ion Beam- And Serial Block Face- Scanning Electron MicroscopyManual Model BuildingManual TracingSemi-automated ApproachesAutomated Custom-designed Segmentation AlgorithmsSurface RenderingQuantitative AnalysisTriage Scheme
