Journal
/
Bio-ingénierie
/
Voksellerden Gönderen Bilgi için: Kompleks Elektron Mikroskopi 3D-Data Bölümlere Göre Pratik Rehber
Journal JoVE
Bio-ingénierie
This content is Free Access.
Journal JoVE Bio-ingénierie
From Voxels to Knowledge: A Practical Guide to the Segmentation of Complex Electron Microscopy 3D-Data
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Voksellerden Gönderen Bilgi için: Kompleks Elektron Mikroskopi 3D-Data Bölümlere Göre Pratik Rehber

DOI:
10.3791/51673-v

•

12:08 min

•

August 13, 2014

•

, , , , , ,
1Life Sciences Division,Lawrence Berkeley National Laboratory, 2Joint Bioenergy Institute, Physical Biosciences Division,Lawrence Berkeley National Laboratory, 3National Energy Research Scientific Computing Center,Lawrence Berkeley National Laboratory

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 02:04Manual Abstracted Model Generation
  • 04:47Manual Tracing of Features of Interest
  • 08:10Automated Density-based Segmentation
  • 09:15Custom-tailored Automated Segmentation
  • 09:41Results: Application of Four Segmentation Approaches to Example Data Sets
  • 11:29Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Hücresel 3D elektron mikroskobu için darboğaz oldukça karmaşık 3D yoğunluk haritalarında özellik çıkarma (segmentasyon) 'dir. Biz dolayısıyla etkili segmentasyon için bir başlangıç ​​noktası sağlayan, segmentasyon yaklaşımı (manuel, yarı otomatik veya tam otomatik) farklı veri türleri için en uygun olduğu konusunda rehberlik sağlamaktadır kriterleri bir dizi geliştirdik.

Tags

3D Electron MicroscopyUltrastructural OrganizationSegmentationVisualizationQuantificationResin Embedded Stained Electron TomographyFocused Ion Beam- And Serial Block Face- Scanning Electron MicroscopyManual Model BuildingManual TracingSemi-automated ApproachesAutomated Custom-designed Segmentation AlgorithmsSurface RenderingQuantitative AnalysisTriage Scheme

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

check_url/fr/51673?article_type=v

Düşük Maliyetli Cryo-Işık Mikroskopi Sahne İmalatı İlişkili Işık / Elektron Mikroskopi
check_url/fr/51673?article_type=v

Devirli Basınç Biyoreaktör Tasarım Ex vivo Eğitim
check_url/fr/51673?article_type=v

Aracı Olarak bir lipozomal-kapsüllü Yakın-Kızılötesi floroforun Floresan-söndürme<em> İn Vivo</em> Optik Görüntüleme
check_url/fr/51673?article_type=v

Çoklu Renkler Yüksek hızında Yapısal Aydınlatma TIRF Mikroskopi A Guide
check_url/fr/51673?article_type=v

Kuantum Nokta Nanopartiküller kullanma Korelatif Işık- ve Elektron Mikroskobu
check_url/fr/51673?article_type=v

Cryo-immobilize hücreler yapılarda bağdaşık ışık elektron izleme ve Viral Protein Imaging mikroskobu (CLEM) ilişkili
check_url/fr/51673?article_type=v

Stres birden çok paralel-plaka akışı Chambers kullanarak yamultmak için maruz endotel hücrelerinin gen ifade Analizi
check_url/fr/51673?article_type=v

Son derece eğimli oluşturmak için bir kılavuz döşeme mikroskop genişletilmiş görünümü alan tek molekül görüntüleme için süpürüldü.
check_url/fr/51673?article_type=v

Erken Osteoartrit tespit etmek için Atomik Kuvvet Mikroskobu Uygulaması
check_url/fr/51673?article_type=v

İnsan kaynaklı Pluripotent Kök Hücre Türevli Kardiyomiyositlerde Tek Hücreli Optik Eylem Potansiyeli Ölçümü

Read Article