Journal
/
Biologie
/
Workflow pour haut-contenu, cellule individuelle quantification des marqueurs fluorescents de Data Universal Microscope, pris en charge par Open Source Software
Journal JoVE
Biologie
This content is Free Access.
Journal JoVE Biologie
Workflow for High-content, Individual Cell Quantification of Fluorescent Markers from Universal Microscope Data, Supported by Open Source Software
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Workflow pour haut-contenu, cellule individuelle quantification des marqueurs fluorescents de Data Universal Microscope, pris en charge par Open Source Software

DOI:
10.3791/51882-v

•

09:57 min

•

December 16, 2014

•

,
1Cancer Biology,UCL Cancer Institute

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 01:17Reverse Transfection siRNA Screening
  • 03:20Imaging and Image Segmentation
  • 05:21Data Extraction
  • 07:39Results: Representative Raw Individual Cell Data Processing
  • 09:27Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Présenté informatique est un workflow flexible permettant multiplexé analyse basée sur l'image de cellules marquées par fluorescence. Le workflow quantifie marqueurs nucléaires et cytoplasmiques et calcule marqueur translocation entre ces compartiments. Des procédures sont prévues pour perturbation de cellules en utilisant siRNA et la méthodologie fiable pour la détection du marqueur par immunofluorescence indirecte dans des formats de 96 puits.

Tags

Cell QuantificationFluorescent MarkersHigh-content MicroscopySingle-cell AnalysisCell HeterogeneityCell ProfilerOpen-source SoftwareSubcellular SegmentationSiRNA ScreenG1 Checkpoint RegulatorsCell PerturbationFluorescence-based Cellular Markers

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

check_url/fr/51882?article_type=v

Un neuronale et astrocytes de co-culture de dosage pour l'analyse du contenu haute de la neurotoxicité
check_url/fr/51882?article_type=v

Imagerie C. elegans Les embryons en utilisant un microscope à épifluorescence et de logiciels Open Source
check_url/fr/51882?article_type=v

Un flux de travail de remise en forme Analyse quantitative
check_url/fr/51882?article_type=v

Un workflow d'imagerie à haute teneur pour étudier Grb2 complexes de signalisation par clonage d'expression
check_url/fr/51882?article_type=v

Profilage individuel embryonnaires humaines Cellules souches par RT-PCR quantitative
check_url/fr/51882?article_type=v

Suivi et quantification des processus de développement des<em> C. elegans</em> Utilisation des outils open-source
check_url/fr/51882?article_type=v

Open Source Content Haute Analyse Utilisant automatisé Fluorescence Lifetime Imaging Microscopy
check_url/fr/51882?article_type=v

Profilage Redox cellulaire utilisant une microscopie haute teneur
check_url/fr/51882?article_type=v

Open Source Analyse unique pour particules super-résolution Microscopie avec VirusMapper
check_url/fr/51882?article_type=v

IR-TEx: Un outil d'intégration de données Open Source pour la transcriptionomique Big Data conçu pour le vecteur antipaludique Anopheles gambiae

Read Article