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Fluxo de trabalho para de alta conteúdo, Quantificação de células individuais de marcadores fluorescentes de Microscópio Universal Data, apoiada pela Open Source Software
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Journal JoVE Biologie
Workflow for High-content, Individual Cell Quantification of Fluorescent Markers from Universal Microscope Data, Supported by Open Source Software

Fluxo de trabalho para de alta conteúdo, Quantificação de células individuais de marcadores fluorescentes de Microscópio Universal Data, apoiada pela Open Source Software

DOI:
10.3791/51882-v

•

09:57 min

•

December 16, 2014

•

,
1Cancer Biology,UCL Cancer Institute

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 01:17Reverse Transfection siRNA Screening
  • 03:20Imaging and Image Segmentation
  • 05:21Data Extraction
  • 07:39Results: Representative Raw Individual Cell Data Processing
  • 09:27Conclusion

Summary

Traduction automatique

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Apresentado é um informática fluxo de trabalho flexível permitindo uma análise baseada em imagem multiplexado de células marcadas com fluorescência. O fluxo de trabalho quantifica marcadores nucleares e citoplasmáticos e calcula marcador translocação entre esses compartimentos. Os procedimentos são fornecidos por perturbação das células utilizando metodologia de siRNA e fiável para a detecção do marcador através de imunofluorescência indirecta em formatos de 96 poços.

Tags

Keywords: Cell QuantificationFluorescent MarkersHigh-content MicroscopySingle-cell AnalysisCell HeterogeneityCell ProfilerOpen-source SoftwareSubcellular SegmentationSiRNA ScreenG1 Checkpoint RegulatorsCell PerturbationFluorescence-based Cellular Markers

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