Journal
/
Biologie
/
Effektiv Nucleic Acid Utvinning og 16S rRNA Gene Sekvense for Bakteriell Fellesskapet Karakterisering
Journal JoVE
Biologie
This content is Free Access.
Journal JoVE Biologie
Efficient Nucleic Acid Extraction and 16S rRNA Gene Sequencing for Bacterial Community Characterization

Effektiv Nucleic Acid Utvinning og 16S rRNA Gene Sekvense for Bakteriell Fellesskapet Karakterisering

DOI:
10.3791/53939-v

•

12:37 min

•

April 14, 2016

•

, ,
1Ragon Institute of MGH, MIT, and Harvard,Massachusetts General Hospital

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 00:57Extraction of Total Nucleic Acid from Cervicovaginal Swabs (Phenol-Chloroform Extraction)
  • 05:52PCR Amplification of the 16S rRNA Gene V4 Hypervariable Region
  • 09:40Library Pooling and High-Throughput Sequencing
  • 10:30Evaluation of Nucleic Acid Extraction and 16S rRNA Gene PCR Amplification
  • 11:35Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Vi beskriver en effektiv, robust og kostnadseffektiv metode for å utvinne nukleinsyre fra vattpinner for karakterisering av bakterielle samfunn ved hjelp av 16S rRNA-genet amplicon sekvensering. Fremgangsmåten gjør det mulig for en vanlig behandling tilnærming for flere prøvetyper og har plass til en rekke nedstrøms analytiske prosesser.

Tags

Nucleic Acid Extraction16S RRNA Gene SequencingBacterial Community CharacterizationSwabsDNARNAHuman SamplesBody SitesNaCl-Tris-EDTA BufferSDSPhenol Chloroform Isoamyl AlcoholBead BeadingHomogenizationCentrifugation

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

Bacterial Gene Expression Analysis Using Microarrays

Elektrisitet-Free, Sekvensiell nukleinsyre-og Protein Isolation

Analysere og bygningsloven Nukleinsyre Structures med 3DNA

Neste-generasjons sekvensering av 16S ribosomalt RNA Gene amplikonene

Meget Effektiv Ligering av små RNA molekyler for mikroRNA kvantifisering av høy gjennomstrømming Sequencing

Enkelt Bulk Avlesning av digitale Nukleinsyre Kvantifisering Analyser

Filtrering Isolering av nukleinsyrer: En enkel og Rapid DNA Extraction Method

Guidet protokoll for Fecal mikrobiell karakterisering av 16S rRNA-Amplicon sekvenser

Tick Microbiome karakterisering av neste generasjons 16S rRNA Amplicon sekvenser

Bakterieflora analyse ved hjelp av to-trinns PCR og neste generasjons 16S rRNA Gene sekvensering

Read Article