Journal
/
Biologie
/
Elektroforetik Hareketlilik Assay (EMSA) ve Shift kullanarak Fonksiyonel Olmayan kodlama Genetik Türevleri için tarama DNA afinite Yağış Deneyi (DAPA)
Journal JoVE
Biologie
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Journal JoVE Biologie
Screening for Functional Non-coding Genetic Variants Using Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA) and DNA-affinity Precipitation Assay (DAPA)
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Elektroforetik Hareketlilik Assay (EMSA) ve Shift kullanarak Fonksiyonel Olmayan kodlama Genetik Türevleri için tarama DNA afinite Yağış Deneyi (DAPA)

DOI:
10.3791/54093-v

•

11:35 min

•

August 21, 2016

•

, , , , ,
1Center for Autoimmune Genomics and Etiology,Cincinnati Children’s Hospital, 2Medical Scientist Training Program,University of Cincinnati, 3Immunology Graduate Program,University of Cincinnati, 4Divisions of Biomedical Informatics and Developmental Biology,Cincinnati Children’s Hospital

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 00:56Preparation of Nuclear Lysate from Cultured Cells
  • 03:19Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA)
  • 06:56DNA Affinity Purification Assay (DAPA)
  • 09:37Results: Non-coding Genetic Variants Affect Transcription Factor DNA Binding
  • 11:04Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

We present a strategic plan and protocol for identifying non-coding genetic variants affecting transcription factor (TF) DNA binding. A detailed experimental protocol is provided for electrophoretic mobility shift assay (EMSA) and DNA affinity precipitation assay (DAPA) analysis of genotype-dependent TF DNA binding.

Tags

Functional Non-coding Genetic VariantsElectrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA)DNA-affinity Precipitation Assay (DAPA)Regulatory ProteinsPathwaysB-lymphoblastoid CellsNuclear LysatesCE BufferNE-bufferDithiothreitol (DTT)Phosphatase InhibitorPhenylmethanesulfonyl Fluoride (PMSF)Nonidet P-40

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

Fareler için açık / koyu Geçiş Testi

Civciv Embriyo Sinir İndüksiyon için Testi

Fareler için Yükseltilmiş Artı Labirent

Yetişkin Mouse Hipokampal dentat girus diseksiyonu

Genetik Dernekleri Fonksiyonel Dayanak Test bir Allel özel Gen İfadesi Testi

GIRK Kanal Modülatörler belirlenmesi için Floresan Tarama Testi

Bakteriyel Fonksiyonel Ağlar ve tanımında Haritalama<em> Escherichia Coli</em> Sentetik Genetik Diziler kullanarak

Bir ev yapımı Çift kızdırma Lusıferaz Testi kullanarak yüksek verim Fonksiyonel Taraması

Gap Kavşak Sınavı Fonksiyonel Testi; İndiyum-Kalay Oksit Yapışık hücrelerin elektroporasyonu

IRE / IRP Örnek: RNA-protein Etkileşimleri Çalışmaları elektroforetik hareketlilik Shift Testi (EMSA)

Read Article