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Ein Protokoll für Functional Assessment of Whole-Protein Sättigungsmutagenese-Bibliotheken mit Hilfe von High-Throughput Sequencing
Journal JoVE
Biologie
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Journal JoVE Biologie
A Protocol for Functional Assessment of Whole-Protein Saturation Mutagenesis Libraries Utilizing High-Throughput Sequencing
DOI:

11:36 min

July 03, 2016

, , ,

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 00:43Synthesis of NNS Sub-libraries for Each Amino Acid Position by Two-step PCR Site-directed Mutagenesis
  • 01:53Cloning of NNS Sub-libraries into Selection Vectors
  • 03:47Selection of the TEM-1 Whole-Protein Saturation Mutagenesis Library for Antibiotic Resistance
  • 05:51High Throughput Sequencing to Determine Fitness Effects of Mutations
  • 08:44Results: High Throughput Sequencing from Whole-Protein Saturation Mutagenesis
  • 10:16Conclusion

Summary

Traduction automatique

Wir stellen ein Protokoll für die funktionelle Bewertung umfassender single-site Sättigungsmutagenese Bibliotheken von Proteinen Hochdurchsatz-Sequenzierung verwendet. Wichtig ist, nutzt dieser Ansatz orthogonalen Primerpaare Bibliothek Konstruktion und Sequenzierung zu multiplexen. Repräsentative Ergebnisse unter Verwendung von TEM-1 β-Lactamase in klinisch relevanter Dosierung von Ampicillin ausgewählt werden bereitgestellt.

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