Journal
/
Biologie
/
ChIP-ekzo Yöntem: Base Çifti Hassas Protein-DNA Etkileşimleri belirlenmesi
Journal JoVE
Biologie
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Journal JoVE Biologie
The ChIP-exo Method: Identifying Protein-DNA Interactions with Near Base Pair Precision
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

ChIP-ekzo Yöntem: Base Çifti Hassas Protein-DNA Etkileşimleri belirlenmesi

DOI:
10.3791/55016-v

•

09:27 min

•

December 23, 2016

•

,
1Department of Molecular Physiology and Biophysics,Vanderbilt University

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 00:41Sonication of Nuclear Lysates
  • 02:31Chromatin Immunoprecipitation
  • 03:55P7 Adapter Ligation and Lambda Exonuclease Reactions
  • 05:06RecJf Nuclease, Crosslink Reversal, and P5 Adapter Ligation Reactions
  • 06:47Results: Chromatin Immunoprecipitation Exo-mediated Protein-DNA Interactions
  • 08:21Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Here, we present a protocol to achieve near base pair resolution of protein-DNA interactions. This is obtained by exonuclease treatment of DNA fragments selectively enriched by chromatin immunoprecipitation (ChIP-exo) followed by high throughput sequencing.

Tags

Keywords: ChIP-exoProtein-DNA InteractionsGene RegulationEpigeneticsTranscription MachineryChromatinSonicationNuclear LysatesChromatin ImmunoprecipitationChIP ReactionAntibody Bead Conjugates

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

check_url/fr/55016?article_type=v

Split-Ubiquitin Dayalı Membran Maya İki Hybrid (MİT) Sistemi: protein-protein etkileşimleri belirlenmesi için güçlü bir araç
check_url/fr/55016?article_type=v

Uzun menzilli DNA Etkileşimleri belirlenmesi için İlişkili Kromozom Tuzak
check_url/fr/55016?article_type=v

EMBL de MultiBac Protein Complex Üretim Platformu
check_url/fr/55016?article_type=v

Protein-DNA Etkileşiminin Çalışmaları Tek molekül Manipülasyon ve Görüntüleme birleştiren
check_url/fr/55016?article_type=v

Peptit Diziler protein-protein etkileşim Siteleri belirlenmesi
check_url/fr/55016?article_type=v

Dalga boyundaki ve Oksidatif Stres Kırmızı / yakın-kızılötesi ışık Terapisi şiddetler bir Range Etkilerinin Değerlendirilmesi için Yöntemi<em> İn Vitro</em
check_url/fr/55016?article_type=v

Baz Çifti Çözünürlük DNA metilasyon Değerlendirme Temsil bisülfit sıralamayı İndirimli pekiştirilmiş
check_url/fr/55016?article_type=v

Bir Kolorimetrik Altın Nanopartikül Testi Uygulanan Yapı-anahtarlama aptamers seçilmesi için bir yöntem
check_url/fr/55016?article_type=v

Arabidopsis Protein-DNA Etkileşimleri Tespiti için Kromatin Immunoprecipitation Deneyi<em> İn Vivo</em
check_url/fr/55016?article_type=v

DamID seq: Adenin-metillenmiş DNA Fragments Yüksek Verimli Dizileme tarafından Protein-DNA Etkileşimleri genom Haritalama

Read Article