Bakterielle effektor proteiner er vigtige for at etablere succesfulde infektioner. Denne protokol beskriver den eksperimentelle identifikation af proteinholdige bindingspartnere af en bakteriel effektor-protein i dets naturlige plantevært. Identifikation disse effektor interaktioner via gær to-hybrid-skærme er blevet et vigtigt redskab i optrevling molekylære patogenicitet strategier.