Sequenciamento de RNA

Entre diferentes métodos para avaliar a expressão genética, o sequenciamento de alto rendimento do RNA, ou RNA-seq. é particularmente atraente, pois pode ser realizada e analisada sem depender de informações genômicas disponíveis prévias. Durante o RNA-seq, o RNA isolado de amostras de interesse é usado para gerar uma biblioteca de DNA, que é então amplificada e sequenciada. Em última análise, o RNA-seq pode determinar quais genes são expressos, os níveis de sua expressão e a presença de quaisquer transcrições até então desconhecidas.

Aqui, a JoVE apresenta os princípios básicos por trás do RNA-seq. Em seguida, discutimos as etapas experimentais e analíticas de um protocolo geral de RNA-seq. Finalmente, examinamos como os pesquisadores estão usando RNA-seq, por exemplo, para comparar a expressão genética entre diferentes amostras biológicas, ou para caracterizar interações proteína-RNA.