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Génétique
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核密度分析的天然染色质沉淀测序文库的生成
Journal JoVE
Génétique
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Génétique
Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis
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Click here for the English version.
核密度分析的天然染色质沉淀测序文库的生成
DOI:
10.3791/56085-v
•
10:05 min
•
December 12, 2017
•
Alireza Lorzadeh
,
Rodrigo Lopez Gutierrez
,
Linda Jackson
,
Michelle Moksa
,
Martin Hirst
2
1
Department of Microbiology and Immunology, Michael Smith Laboratories Centre for High-Throughput Biology
,
University of British Columbia
,
2
Canada’s Michael Smith Genome Science Center
,
BC Cancer Agency
Chapitres
00:05
Titre
00:51
Cell Lysis and Chromatin Digestion for Nucleosome Density ChIP-se
03:21
Immunprecipitation Reaction for Nucleosome Density ChIP-seq
04:33
Washes and Elution for Nucleosome Density ChIP-seq
07:31
Results: Evaluation of Nucleosome Density ChIP-seq Libraries
08:50
Conclusion
Summary
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我们提出了一个改良的本地染色质沉淀测序 (芯片-seq) 的方法, 以生成序列数据集适合核密度芯片-seq 分析框架集成 micrococcal 核酸 (MNase) 可及性组蛋白修饰测量。
Tags
Native Chromatin Immunoprecipitation
Nucleosome Density Analysis
Epigenetics
Epigenomic Features
Chromatin Signatures
MNase
Cell Preparation
Lysis Buffer
MNase Digestion
EDTA
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