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Mapping Genome-wide Accessible Chromatin in Primary Human T Lymphocytes by ATAC-Seq
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Mapping genomweite zugänglich Chromatin in primären menschlichen T-Lymphozyten durch ATAC-Seq

DOI:
10.3791/56313-v

•

09:08 min

•

November 13, 2017

•

, , , ,
1The Mina and Everard Goodman Faculty of Life Sciences,Bar-Ilan University

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 00:54Purification of Naïve Human CD4+ Cells, Polarization to Th1 and TH2 Cells, and Nuclei Extraction
  • 03:18Transposition Reaction and Library Amplification
  • 04:33Size Selection of ATAC-seq Libraries
  • 06:48Results: Quality Control and Next Generation Sequencing Reads
  • 08:07Conclusion

Summary

Traduction automatique

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Test für Transposase zugänglichen Chromatin gepaart mit Hochdurchsatz-Sequenzierung (ATAC-Seq) ist eine genomweite Methode zugänglich Chromatin aufzudecken. Dies ist ein Schritt für Schritt ATAC-Seq-Protokoll von molekularen bis die abschließende computergestützte Analyse, optimiert für menschlichen Lymphozyten (Th1/Th2). Dieses Protokoll kann von Wissenschaftlern ohne Vorkenntnisse in Next Generation Sequencing Methoden übernommen werden.

Tags

ATAC-SeqChromatin AccessibilityGenome-wideRegulatory ElementsT LymphocytesEpigenomicsPrimary CellsTransposaseNuclei IsolationTh1Th2Cell Activation

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