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Mappatura del genoma della cromatina accessibile in linfociti T umani primari da ATAC-Seq
Journal JoVE
Génétique
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Journal JoVE Génétique
Mapping Genome-wide Accessible Chromatin in Primary Human T Lymphocytes by ATAC-Seq
DOI:

09:08 min

November 13, 2017

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Chapitres

  • 00:05Titre
  • 00:54Purification of Naïve Human CD4+ Cells, Polarization to Th1 and TH2 Cells, and Nuclei Extraction
  • 03:18Transposition Reaction and Library Amplification
  • 04:33Size Selection of ATAC-seq Libraries
  • 06:48Results: Quality Control and Next Generation Sequencing Reads
  • 08:07Conclusion

Summary

Traduction automatique

Analisi per Transposase-accessibile della cromatina accoppiato con sequenziamento ad alta produttività (ATAC-seq) è un metodo di genoma per scoprire accessibile della cromatina. Questo è un protocollo di ATAC-seq passo dopo passo, da molecolari all'analisi computazionale del finale, ottimizzato per i linfociti umani (Th1/Th2). Questo protocollo può essere adottato da ricercatori senza precedente esperienza nei metodi di sequenziamento di nuova generazione.

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