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깊은 프로테옴 Isobaric 라벨, 광범위 한 액체 크로마토그래피, 질량 분석 및 소프트웨어 기반 정량화 하 여 프로 파일링

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Deep Proteome Profiling by Isobaric Labeling, Extensive Liquid Chromatography, Mass Spectrometry, and Software-assisted Quantification

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깊은 프로테옴 Isobaric 라벨, 광범위 한 액체 크로마토그래피, 질량 분석 및 소프트웨어 기반 정량화 하 여 프로 파일링

DOI:

10.3791/56474-v

•

10:37 min

•

November 15, 2017

•

Anthony A. High, Haiyan Tan, Vishwajeeth R. Pagala, Mingming Niu³, Ji-Hoon Cho, Xusheng Wang, Bing Bai, Junmin Peng²

¹St. Jude Proteomics Facility,St. Jude Children’s Research Hospital, ²Departments of Structural Biology and Developmental Neurobiology,St. Jude Children’s Research Hospital, ³Heilongjiang University of Chinese Medicine

Chapitres

00:05Titre
01:00Preparation of Cells/Tissues
01:45Protein Extraction, Quality Control Western Blotting, In-solution Digestion, and Peptide Desalting
04:45TMT Labeling of Peptides
05:50Extensive High-resolution, Basic pH LC Prefactionation
06:43LC-MS/MS Preparation and Parameters
07:41Results: Deep Proteome Profiling Analysis
08:45Conclusion

Summary

Traduction automatique

우리는 정확 하 게 액체 크로마토그래피 고해상도 질량 분석기에 인터페이스와 isobaric 라벨, 광범위 한 분류, 생물 정보학 도구, 그리고 품질 관리 단계에에서는 단백질을 quantitate 프로토콜을 제시.

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Keywords: Proteome Profiling Isobaric Labeling Liquid Chromatography Mass Spectrometry Quantification Protein Identification Protein Quantitation Biomarker Discovery Cell Lysis Protein Digestion Acetonitrile Lys-C Protease DTT HEPES

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