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Umfassenden Workflow zur genomweiten Identifizierung und Ausdruck Meta-Analyse von der ATL E3 Ubiquitin Ligase Genfamilie in Grapevine
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Journal JoVE Biologie
Comprehensive Workflow for the Genome-wide Identification and Expression Meta-analysis of the ATL E3 Ubiquitin Ligase Gene Family in Grapevine
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Umfassenden Workflow zur genomweiten Identifizierung und Ausdruck Meta-Analyse von der ATL E3 Ubiquitin Ligase Genfamilie in Grapevine

DOI:
10.3791/56626-v

•

10:40 min

•

December 22, 2017

•

, , , , , ,
1Dipartimento di Biotecnologie,Università degli Studi di Verona, 2Ecology and Evolution, Research School of Biology,The Australian National University, 3Dipartimento di Agraria, SACEG,Università degli Studi di Sassari

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 01:04Identifying Putative Gene Family Members, Making Alignments, and Sequence Logos
  • 03:33Phylogenetic Analysis and Nomenclature
  • 06:51Tissue Expression Meta-analysis
  • 08:27Results: Identified ATL Gene Family Members in the Grapevine Genome
  • 09:52Conclusion

Summary

Traduction automatique

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Dieser Artikel beschreibt das Verfahren für die Identifizierung und Charakterisierung einer Genfamilie in Grapevine, die zur Familie der Arabidopsis Tóxicos in Levadura (ATL) E3 Ubiquitin Ligases angewendet.

Tags

Genome-wide IdentificationExpression Meta-analysisATL E3 Ubiquitin Ligase Gene FamilyGrapevineGene StructureProtein MotifsChromosomal LocationGene DuplicationsExpression PatternsGene Family CharacterizationProtein BLASTPSI-BLASTFASTABioinformatics Software

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