Journal
/
Biologie
/
Guidede protokol for fækal mikrobielle karakterisering af 16S rRNA-amplikon sekventering
Journal JoVE
Biologie
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Journal JoVE Biologie
Guided Protocol for Fecal Microbial Characterization by 16S rRNA-Amplicon Sequencing

Guidede protokol for fækal mikrobielle karakterisering af 16S rRNA-amplikon sekventering

DOI:
10.3791/56845-v

•

08:05 min

•

March 19, 2018

•

, , , , , , , ,
1Sheba Medical Center, 2Children’s Hospital of Pittsburgh of UPMC, 3Ariel University, 4Cincinnati Children’s Hospital Medical Center

Chapitres

  • 00:04Titre
  • 00:59Sample Handling and DNA Extraction
  • 02:12PCR and Library Preparation
  • 05:30Results: 16S RNA-Seq of Prepared Libraries
  • 07:19Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Dette manuskript beskriver en detaljeret standardiseret protokol af høj overførselshastighed 16S rRNA-amplikon sekvensering. Protokollen introducerer en integreret, uniformerede, gennemførlige og billig protokol fra fecal prøvetagning gennem data analyser. Denne protokol giver mulighed for analyse af store mængder prøver med strenge standarder og flere kontrolelementer.

Tags

Keywords: 16S RRNA-Amplicon SequencingFecal MicrobiomeMicrobial CompositionAerobic And Anaerobic CommunitiesHigh-throughputFecal Sample ProcessingDNA ExtractionPCRPrimer Design96-well Plate SetupTriplicate ReactionsPCR Master Mix

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

check_url/fr/56845?article_type=v

Pyrosequencing for Mikrobiel identifikation og karakterisering
check_url/fr/56845?article_type=v

Næste generations sekventering af 16S ribosomalt RNA Gene Amplikoner
check_url/fr/56845?article_type=v

Målrettet DNA methyleringsanalyse by Next generation Sequencing
check_url/fr/56845?article_type=v

Isolering af specifikke genomiske regioner og Identifikation af associerede molekyler ved enChIP
check_url/fr/56845?article_type=v

Fækal Glukokortikoid Analyse: Non-invasive Adrenal Overvågning i dyr fra hestefamilien
check_url/fr/56845?article_type=v

Effektiv Nucleic Acid Udvinding og 16S rRNA Gene sekventering for bakteriel Community karakterisering
check_url/fr/56845?article_type=v

En protokol for Funktionel vurdering af Whole-Protein Saturation mutagenese Biblioteker hjælp High-Throughput Sequencing
check_url/fr/56845?article_type=v

Interactome-Seq: En protokol til Domainome bibliotek konstruktion, validering og udvælgelse af Phage Display og næste Generation Sequencing
check_url/fr/56845?article_type=v

Kryds Microbiome karakterisering af næste generations 16S rRNA-amplikon sekventering
check_url/fr/56845?article_type=v

Mikrobiota-analyse ved hjælp af to-trins PCR og næste generations 16S rRNA-Gensekvensering

Read Article