Journal
/
Recherche en cancérologie
/
Een geïntegreerd Platform voor het toewijzen van de genoom-brede van chromatine Staten met behulp van High-throughput ChIP-sequencing in Tumor weefsels
Journal JoVE
Recherche en cancérologie
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Journal JoVE Recherche en cancérologie
An Integrated Platform for Genome-wide Mapping of Chromatin States Using High-throughput ChIP-sequencing in Tumor Tissues
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Een geïntegreerd Platform voor het toewijzen van de genoom-brede van chromatine Staten met behulp van High-throughput ChIP-sequencing in Tumor weefsels

DOI:
10.3791/56972-v

•

10:41 min

•

April 05, 2018

•

, , , , , , ,
1Department of Genomic Medicine,University of Texas MD Anderson Cancer Center, 2The Jackson Laboratory for Genomic Medicine

Chapitres

  • 00:04Titre
  • 00:31Tissue/Cell Line Processing and Cross-linking
  • 01:57Tissue Lysis, Sonication, and Antibody Preparation
  • 02:52Chromatin Immunoprecipitation
  • 03:40Washing and Reverse Cross-linking of Immunoprecipitated DNA-protein Complexes
  • 04:43Purification and Quantification of Precipitated DNA
  • 06:00Library Generation Using the NEBNext Ultra II DNA Library Preparation Kit
  • 07:53Results: Immunoprecipitation of Tumor Tissues and Cells Using High-throughput ChIP-sequencing
  • 09:23Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Hier beschrijven we een geoptimaliseerde high-throughput ChIP-sequencing protocol en computationele analyses pijpleiding voor de bepaling van genoom-brede chromatine staat patronen uit bevroren tumor weefsels en cellijnen.

Tags

Chromatin StatesChIP-sequencingCancer EpigeneticsHistone ModificationsChromatin FragmentsHistone AntibodiesProtein G Magnetic BeadsChIP Dilution Buffer

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

check_url/fr/56972?article_type=v

De<em> Drosophila</em> Imaginal Disc Tumor Model: visualisatie en kwantificering van genexpressie en Tumor Invasiviteit met behulp van genetische Mozaïeken
check_url/fr/56972?article_type=v

De oprichting van een Long kolonisatie Assay voor het circulerende Tumor visualisatie van de cel in de weefsels van de longen
check_url/fr/56972?article_type=v

Genoom-brede RNAi Screening factoren te identificeren Host die moduleren van oncolytische Virus therapie
check_url/fr/56972?article_type=v

Native chromatine Immunoprecipitation met behulp van lymfkliertest Brain Tumor Neurospheres
check_url/fr/56972?article_type=v

Generatie van High-Throughput driedimensionale Tumor spheroïden voor Drug Screening
check_url/fr/56972?article_type=v

Digitale Polymerase Chain Reaction Assay voor de genetische variatie in een sporadische familiale adenomateuze Polyposis patiënt met behulp van de Chip-in-a-tube-indeling
check_url/fr/56972?article_type=v

In vitro assay om tumor-macrofaag interactie te bestuderen
check_url/fr/56972?article_type=v

Oprichting en karakterisering van de neuro-endocriene tumor Spheroids van de kleine darm
check_url/fr/56972?article_type=v

Genoombrede analyse van DNA-methylatie bij maag- en darmkanker
check_url/fr/56972?article_type=v

Patiënt-afgeleide tumor explanteert als een "live" preklinisch platform voor het voorspellen van medicijnresistentie bij patiënten

Read Article