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Quantification of Site-specific Protein Lysine Acetylation and Succinylation Stoichiometry Using Data-independent Acquisition Mass Spectrometry
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Quantification des protéines spécifiques au site Lysine acétylation et stoechiométrie Succinylation spectrométrie de masse indépendante des données Acquisition

DOI:
10.3791/57209-v

•

12:49 min

•

April 04, 2018

•

, ,
1Buck Institute for Research on Aging

Chapitres

  • 00:04Titre
  • 01:18Quantitatively Acetylate and/or Succinylate Proteins Using Isotope-labeled Acetic or Succinic Anhydride
  • 03:48Digest Reacted Protein Samples Using Glu-C Endoproteinase
  • 06:27Fractionate Peptides Using Offline Basic-pH Reversed Phase HPLC
  • 08:15Example Data Analysis Tutorial
  • 10:28Results: Succinylation Stoichiometry Ratio Calculation of Pre-succinylated BSA
  • 11:13Conclusion

Summary

Traduction automatique

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Nous présentons ici la quantification objective des protéines spécifiques au site acétylation et/ou succinylation occupation (stoechiométrie) un proteome ensemble grâce à une analyse logométrique de modifications endogènes aux modifications introduites après quantitative acylation chimique utilisant des anhydrides stables isotopes marqués. En combinaison avec la spectrométrie de masse sensibles acquisition indépendante des données, mesures d’occupation de site précis sont obtenus.

Tags

Keywords: Site-specific Protein Lysine AcetylationSite-specific Protein Lysine SuccinylationStoichiometryData-independent Acquisition Mass SpectrometryPost-translational ModificationProtein RegulationLysine AcylationChemical AcetylationChemical SuccinylationFragment Ion Quantification

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