CARIP-Seq and ChIP-Seq: Methods to Identify Chromatin-Associated RNAs and Protein-DNA Interactions in Embryonic Stem Cells

Benjamin L. Kidder

doi:10.3791/57481

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Biologie du développement

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CARIP-Seq और चिप-Seq: क्रोमेटिन-संबद्ध RNAs और प्रोटीन-भ्रूण स्टेम कोशिकाओं में डीएनए बातचीत की पहचान करने के तरीके

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CARIP-Seq and ChIP-Seq: Methods to Identify Chromatin-Associated RNAs and Protein-DNA Interactions in Embryonic Stem Cells

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CARIP-Seq और चिप-Seq: क्रोमेटिन-संबद्ध RNAs और प्रोटीन-भ्रूण स्टेम कोशिकाओं में डीएनए बातचीत की पहचान करने के तरीके

DOI:

10.3791/57481-v

•

11:13 min

•

May 25, 2018

•

Benjamin L. Kidder²

¹Department of Oncology,Wayne State University School of Medicine, ²Karmanos Cancer Institute,Wayne State University School of Medicine

Chapitres

00:04Titre
01:02Crosslinking of Embryonic Stem Cells for ChIP and CARIP
02:29Chromatin Sonication for ChIP and CARIP
03:48ChIP and CARIP Process
07:12Double-stranded cDNA Synthesis for CARIP-Seq
08:53Use of ChIP-Seq and CARIP-Seq to Study Global Protein-DNA Interactions and Chromatin-Associated RNAs in Embryonic Stem Cells
10:43Conclusion

Summary

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यहाँ, हम अगली पीढ़ी के अनुक्रमण के लिए पुस्तकालय तैयारी सहित चिप Seq और CARIP-Seq, प्रदर्शन करने के लिए तरीकों का वर्णन, ES कोशिकाओं में वैश्विक epigenomic और क्रोमेटिन-जुड़े आरएनए नक्शे उत्पन्न करने के लिए.

CARIP-Seq और चिप-Seq: क्रोमेटिन-संबद्ध RNAs और प्रोटीन-भ्रूण स्टेम कोशिकाओं में डीएनए बातचीत की पहचान करने के तरीके

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