CARIP-Seq and ChIP-Seq: Methods to Identify Chromatin-Associated RNAs and Protein-DNA Interactions in Embryonic Stem Cells

Benjamin L. Kidder

doi:10.3791/57481

/

CARIP-Seq og ChIP-Seq: metoder for å identifisere Chromatin-assosiert RNAs og Protein-DNA interaksjoner i embryonale stamceller

Journal JoVE
Biologie du développement

Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu. Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.

Journal JoVE Biologie du développement

CARIP-Seq and ChIP-Seq: Methods to Identify Chromatin-Associated RNAs and Protein-DNA Interactions in Embryonic Stem Cells

CARIP-Seq og ChIP-Seq: metoder for å identifisere Chromatin-assosiert RNAs og Protein-DNA interaksjoner i embryonale stamceller

DOI:

10.3791/57481-v

•

11:13 min

•

May 25, 2018

•

Benjamin L. Kidder²

¹Department of Oncology,Wayne State University School of Medicine, ²Karmanos Cancer Institute,Wayne State University School of Medicine

Chapitres

00:04Titre
01:02Crosslinking of Embryonic Stem Cells for ChIP and CARIP
02:29Chromatin Sonication for ChIP and CARIP
03:48ChIP and CARIP Process
07:12Double-stranded cDNA Synthesis for CARIP-Seq
08:53Use of ChIP-Seq and CARIP-Seq to Study Global Protein-DNA Interactions and Chromatin-Associated RNAs in Embryonic Stem Cells
10:43Conclusion

Summary

Traduction automatique

Her beskriver vi metoder for å utføre ChIP-Seq og CARIP-Seq, inkludert biblioteket forberedelse til neste generasjons sekvensering, genererer globale epigenomic og chromatin-assosiert RNA kart i ES celler.

CARIP-Seq og ChIP-Seq: metoder for å identifisere Chromatin-assosiert RNAs og Protein-DNA interaksjoner i embryonale stamceller

•

•

•

Chapitres

Summary

Traduction automatique

Tags

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

Genome-wide Snapshot av Chromatin regulatorer og statene i<em> Xenopus</em> Embryoer av Chip-Seq

Neural Differensiering av mus embryonale stamceller i Serum-free enlagskultur

Generering CRISPR / Cas9 mediert Monoallelic Slett å studere Enhancer funksjon i mus embryonale stamceller

Epigenetisk regulering av Cardiac Differensiering av embryonale stamceller og vev

Isolering av Murine Embryonic Hemogenic endotelceller

En enkel metode for å identifisere kinaser som regulerer embryonisk stamcellepluripotens ved høy gjennomstrømningsinhibitor screening

Horisontal helmontering: En romanbehandlings- og bildeprotokoll for tykke, tredimensjonale vev Tverrsnitt av huden

Rask, rettet differensiering av netthinnens Pigment epitelceller fra menneskelige embryonale eller indusert Pluripotent stamceller

Encellede Photoconversion i levende intakt sebrafisk

Beregningsorientert analyse av Caenorhabditis elegans Germline å studere distribusjon av kjerner, proteiner og Cytoskeleton

Read Article