Contrast-Matching Detergent in Small-Angle Neutron Scattering Experiments for Membrane Protein Structural Analysis and <em>Ab Initio</em> Modeling

Ryan C. Oliver; Swe-Htet Naing; Kevin L. Weiss; Sai Venkatesh Pingali; Raquel L. Lieberman; Volker S. Urban

doi:10.3791/57901

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Correspondance de contraste de détergent dans les expériences de diffusion de neutrons de petits angles pour l’analyse structurale de protéines membranaires et la modélisation de Ab Initio

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Biochimie

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Contrast-Matching Detergent in Small-Angle Neutron Scattering Experiments for Membrane Protein Structural Analysis and Ab Initio Modeling

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Correspondance de contraste de détergent dans les expériences de diffusion de neutrons de petits angles pour l’analyse structurale de protéines membranaires et la modélisation de Ab Initio

DOI:

10.3791/57901-v

•

10:27 min

•

October 21, 2018

•

Ryan C. Oliver, Swe-Htet Naing, Kevin L. Weiss, Sai Venkatesh Pingali, Raquel L. Lieberman, Volker S. Urban

¹Neutron Scattering Division,Oak Ridge National Laboratory, ²School of Chemistry and Biochemistry,Georgia Institute of Technology

Chapitres

00:04Titre
00:54Determine Neutron Contrast Match Points and Necessary Contrast for Protein Measurement
02:05Express and Purify the Membrane Protein of Interest
03:25Collect SANS Data and Reduce SANS Data from 2D Image to 1D Plot
04:48Analyze Data for Structural Parameters of the Scattering Particle
07:06Create Ab Initio Models from the SANS Data
08:17Results: Visualization of the Experimental SANS Envelope and Overlay with High-resolution Model using PyMOL
09:40Conclusion

Summary

Traduction automatique

Ce protocole montre comment obtenir un modèle basse résolution ab initio et des détails de structure d’une protéine de membrane solubilisée détergent en solution par la diffusion des neutrons de petits angles avec filtrage de contraste du détergent.

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