February 19th, 2019
Het systeem van de analyse van een software gebaseerde image biedt een alternatieve methode om te studeren van de morfologie van soorten stoloniferous en vaste. Dit protocol maakt meting van de lengte en de diameter van de vegetatieve en wortelstokken en kan worden toegepast op monsters met een grote hoeveelheid biomassa en op een grote verscheidenheid van soorten.
Deze methode kan antwoord geven op belangrijke vragen in de groei en morfologie van stolons en wortelstokken van verschillende gewassen zoals grasgrassen, weiden en weilanden. Het belangrijkste voordeel van deze techniek is dat stolon en wortelstoklengte kunnen worden gemeten in monsters met een grote hoeveelheid biomassa waarvoor gewicht de enige parameter is die momenteel wordt gebruikt. Verzamel monsters met behulp van een bodem kern sampler.
Neem de bovengrondse biomassa en een bodemlaag met een passende diepte, afhankelijk van de soort om de inzameling van zowel stolons en wortelstokken te garanderen. U ook de oppervlakte definiëren om te verzamelen met een frame en de monsters met een spade te verzamelen. Label elk monster met laboratoriumtape.
Om de biomassamonsters schoon te maken, plaatst u het monster in een grote zeef met openingen van 0,5 tot 1,5 millimeter, afhankelijk van de stolon- of wortelstokgrootte. De openingen moeten klein genoeg zijn om alle stolons en wortelstokken te behouden, maar groot genoeg om de bodemdeeltjes te verwijderen. Reinig de monsters met een stroom water met voldoende kracht om bodemdeeltjes te verwijderen zonder de planten te beschadigen.
Haal de schone monsters en leg ze in een lade met papieren handdoeken, zorg ervoor dat de trays op de juiste manier label. Maak de monsters verder schoon door wortels en bladeren met een schaar te verwijderen. Tijdens dit proces, scheiden de stolons en wortelstokken indien nodig en registreren aanvullende informatie, zoals het aantal planten, helmstokken, en stolons per plant.
Doe de stolons en wortelstokken in papieren zakken met het label. Plaats het monster op een transparante kunststof bak van de WinRHIZO standaard scanapparatuur. Plaats de stolons en wortelstokken handmatig met behulp van laboratoriumforceps om overlappingen te minimaliseren.
Het kan nodig zijn grote monsters te verdelen in submonsters. Plaats de lade op het oppervlak van de scanner, schakel vervolgens de scanner in en start met het uitvoeren van het programma. Voor meer controle in een opgeslagen afbeelding, controleer de afbeelding dpi in het menu Afbeelding door de opdracht Image Acquisition Parameter te selecteren.
Controleer de drempelwaarde en analyse voor een goede classificatie van pixels die behoren tot de gescande organen door de opdracht Root Background Distinction te selecteren. Controleer of het hele ladeoppervlak wordt gescand in het menu Afbeelding door de parameter voor de aankoop van de opdracht afbeelding te selecteren. Controleer nu de diameterklasse die wordt weergegeven voor de verdeling van organen per diameter in het grafische gebied boven de gescande afbeelding.
Selecteer 20 klassen van gelijke breedte met intervallen van 0,1 millimeter door op horizontale toegang van de grafiek te klikken. Deze functie maakt het mogelijk gegevens van wortels of kleine organen uit te sluiten wanneer stolons of wortelstokken niet perfect werden gereinigd. De literatuur meldt dat de meeste wortels van grassoorten een diameter lager hebben dan 0,2 millimeter.
Voer het eerste voorbeeld scannen en controleer of de bewerking zorgt voor een goede analyse. Volg de software-instructies voor het opslaan van de afbeelding. Ten slotte verwerkt u de analyse van de volgende softwareoptie en labelt u de afbeelding en analyse met het voorbeeldlabel.
Ga verder met het scannen van alle monsters. Om het droge gewicht te meten, plaatst u de gescande monsters in een geterde aluminiumlade op een nauwkeurige elektronische balans en registreert u hun tarra. Herhaal deze stap voor alle gescande monsters.
Steek alle monsters in een vaak ingesteld op 105 graden Celsius en droog ze gedurende 24 uur. De volgende dag, verwijder de monsters en wacht tot het weefsel gewicht is gestabiliseerd. Dan, weeg alle monsters met hun tarra.
Trek het tarra af van het geregistreerde gewicht om het nettogewicht van elk monster te verkrijgen. Voorbeeld resultaten van een veld proef met het vergelijken van de stolon en wortelstok lengte dichtheid van vier turf-type Bermudagrass cultivars worden getoond. Er is een significant verschil in de stolonlengtedichtheid tussen de vegetatieve cultivars Patriot en Tifway, en de gezaaide cultivars La Paloma en Yukon in monsters die in juli 2014 werden verzameld.
Voor de wortelstokken, Patriot toont de hoogste lengte dichtheid, gevolgd door Tifway, en de gezaaide cultivars. De ontwikkeling van stolonlengtedichtheid van cultivar Patriot gedurende de studieperiode toont een toename van maart 2014 tot juli 2014 en varieerde niet van juli 2014 tot juli 2015. Er zijn weinig wortelstokken gevonden in monsters die in oktober 2013 en maart 2014 zijn verzameld.
Rhizome lengtedichtheid toeneemt in juli 2014, het bereiken van de hoogste waarden. Maar het daalt weer in oktober 2014. Bij het proberen van deze procedure, is het belangrijk om te onthouden om representatieve monsters te selecteren, om nauwgezet stolons en wortelstokken te reinigen voor analyse, en om de breedte van diameterklassen te selecteren met behulp van softwareopties om alleen stolons en wortelstokken in de analyse op te nemen.
Dit artikel presenteert een softwaregebaseerd beeldanalysesysteem dat is ontworpen om de morfologie van stolonifère en rhizomateuze soorten te bestuderen. Het protocol maakt het mogelijk om de lengte en diameter van stolons en rizomen te meten, toepasbaar op monsters met aanzienlijke biomassa.