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Tick Microbiome caratterizzazione ordinando Amplicon del rRNA 16S di prossima generazione
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Biologie
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Journal JoVE Biologie
Tick Microbiome Characterization by Next-Generation 16S rRNA Amplicon Sequencing
DOI:

07:21 min

August 25, 2018

,

Chapitres

  • 00:04Titre
  • 00:44Tick Surface Sterilization, DNA Purification, and 16S rRNA Gene Amplification
  • 02:3016S Amplicon Purification
  • 03:59Sample Barcoding and Purification
  • 04:58Library Quantification and Normalization
  • 06:01Results: Community Ecology of the Ixodes Microbiome
  • 06:43Conclusion

Summary

Traduction automatique

Qui presentiamo un protocollo di sequenziamento di nuova generazione per rRNA 16S che consente l'identificazione e la caratterizzazione delle comunità microbiche all'interno di vettori. Questo metodo prevede l'estrazione di DNA, amplificazione e codici a barre dei campioni mediante PCR, sequenziamento su una cella di flusso e la bioinformatica per abbinare i dati di sequenza filogenetica informazioni.

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