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Cuantificación automatizada basada en imágenes de trampas extracelulares de neutrófilos mediante NETQUANT

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Journal JoVE Immunologie et infection

Automated Image-Based Quantification of Neutrophil Extracellular Traps Using NETQUANT

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Cuantificación automatizada basada en imágenes de trampas extracelulares de neutrófilos mediante NETQUANT

DOI:

10.3791/58528-v

•

07:33 min

•

November 27, 2019

•

Tirthankar Mohanty, Pontus Nordenfelt

¹Department of Clinical Sciences, Division of Infection Medicine,Lund University

Chapitres

00:04Titre
00:34Analysis and Quantification of Neutrophil Extracellular Traps (NETs)
02:19Segmentation of Cells in the DNA Channel and the NET Channel
03:41Single-cell Analysis of Identifiable Properties
04:19Comparison of Cell Properties to Identify NET-forming Cells
05:23Result Outputs Demeanor
06:16Results: Analysis of NET Formation
07:07Conclusion

Summary

Traduction automatique

Aquí, presentamos un protocolo para generar trampas extracelulares de neutrófilos (NET) y operar NETQUANT, una opción de software totalmente automática para la cuantificación de NETs en imágenes de inmunofluorescencia.

Tags

Keywords: NETQUANT Automated Image Analysis Neutrophil Extracellular Traps (NETs)Immunofluorescence Imaging Image Segmentation Adaptive Segmentation DNA Channel NET Channel Sample Types Batch Processing Image Metadata Zenodo Nordonfelt Lab

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