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Large-scale Top-down Proteomics Using Capillary Zone Electrophoresis Tandem Mass Spectrometry

Em grande escala proteômica de cima para baixo usando zona capilar eletroforese espectrometria de massa em Tandem

DOI:
10.3791/58644-v

•

10:05 min

•

October 24, 2018

•

, , , , ,
1Department of Chemistry,Michigan State University, 2Department of BioHealth Informatics,Indiana University-Purdue University Indianapolis, 3Center for Computational Biology and Bioinformatics,Indiana University School of Medicine

Chapitres

  • 00:04Titre
  • 00:27Etching of the Capillary with Hydrofluoric Acid
  • 02:04Set-up of the CZE-MS/MS System and Analysis of the Samples
  • 06:45Database Search of the Collected Raw Files with the TopPIC Software
  • 08:05Results: Identification and Characterization of Proteoforms
  • 09:14Conclusion

Summary

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Um protocolo detalhado é descrito para a separação, identificação e caracterização de proteoforms em amostras de proteínas usando a zona capilar eletroforese-electrospray em tandem-ionização espectrometria de massa (CZE-ESI-MS/MS). O protocolo pode ser usado para a caracterização de alta resolução do proteoforms em amostras da proteína simples e a identificação em larga escala de proteoforms em amostras complexas proteome.

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Keywords: ProteomicsCapillary Zone ElectrophoresisMass SpectrometryProtein IsoformsProtein Post-translational ModificationsSample PreparationCapillary CoatingCapillary EtchingCZE System Setup

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