Determining 3'-Termini and Sequences of Nascent Single-Stranded Viral DNA Molecules during HIV-1 Reverse Transcription in Infected Cells

Darja Pollpeter; Andrew Sobala; Michael H. Malim

doi:10.3791/58715

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Bestimmende 3'-Termini und Sequenzen der im Entstehen begriffenen einsträngige virale DNA-Moleküle während HIV-1 Reverse Transkription in infizierten Zellen

Journal JoVE
Génétique

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Determining 3′-Termini and Sequences of Nascent Single-Stranded Viral DNA Molecules during HIV-1 Reverse Transcription in Infected Cells

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Bestimmende 3'-Termini und Sequenzen der im Entstehen begriffenen einsträngige virale DNA-Moleküle während HIV-1 Reverse Transkription in infizierten Zellen

DOI:

10.3791/58715-v

•

13:07 min

•

January 30, 2019

•

Darja Pollpeter, Andrew Sobala, Michael H. Malim

¹Department of Infectious Diseases, School of Immunology & Microbial Sciences,King’s College London

Chapitres

00:04Titre
00:32HIV-1 DNA Enrichment by Hybrid Capture
03:54Adaptor Ligation
06:03Adaptor Removal and Size Separation
09:36DNA Extraction
11:13Results: Characterization of Nascent Retroviral cDNAs within HIV-1 Infected Cells
12:40Conclusion

Summary

Traduction automatique

Hier präsentieren wir einen Tiefe Sequenzierung Ansatz, der eine objektive Bestimmung der im Entstehen begriffenen 3'-Termini sowie mutagenen Profile der einzelsträngigen DNA-Moleküle enthält. Die Hauptanwendung ist die Charakterisierung der im Entstehen begriffenen retrovirale ergänzende DNAs (cDNAs), die Zwischenprodukte, die während des Prozesses der retroviralen reversen Transkription generiert.

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