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Sequenziamento di lettura ultra-lungo per analisi di DNA Genomic intero
Journal JoVE
Bio-ingénierie
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Journal JoVE Bio-ingénierie
Ultra-long Read Sequencing for Whole Genomic DNA Analysis
DOI:

10:34 min

March 15, 2019

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Chapitres

  • 00:04Titre
  • 01:24High-molecular Weight (HMW) DNA Extraction
  • 03:11Ultra-long DNA Library Construction – Mechanical Shearing-based Protocol
  • 05:19Ultra-long DNA Library Construction – Transposase Fragmentation-based Protocol
  • 06:23Sequencing on the Nanopore Device
  • 07:52Results: Ultra-long DNA Sequencing Protocol
  • 09:38Conclusion

Summary

Traduction automatique

Lungo-ha letto sequenze notevolmente facilitano l'assemblaggio di complessi genomi e caratterizzazione di variazione strutturale. Descriviamo un metodo per generare sequenze ultra-lunghi di piattaforme nanopore di sequenziamento. L'approccio adotta un'estrazione di DNA ottimizzata seguita da preparazioni di libreria modificata per generare centinaia di kilobase letture con moderata copertura da cellule umane.

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