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ATAC-seq analisi con DNA mitocondriale bassa contaminazione da primaria umana CD4 + linfociti T

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ATAC-seq Assay with Low Mitochondrial DNA Contamination from Primary Human CD4+ T Lymphocytes

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ATAC-seq analisi con DNA mitocondriale bassa contaminazione da primaria umana CD4 + linfociti T

DOI:

10.3791/59120-v

•

08:36 min

•

March 22, 2019

•

Hannah D. Rickner, Sheng-Yong Niu², Christine S. Cheng³

¹Department of Biology,Boston University, ²Department of Computer Science and Engineering,University of California San Diego, ³Bioinformatics Program,Boston University

Chapitres

00:04Titre
00:55Activation and Purification of CD4+ T Cells
04:36Assay for Transposase-accessible Chromatin Sequencing (ATAC-seq)
06:33Results: ATAC-seq and Sequencing Result Analysis
07:48Conclusion

Summary

Traduction automatique

Qui, presentiamo un protocollo per eseguire un test per transposase-accessibile della cromatina (ATAC-seq) la sequenziazione su linfociti CD4 + umani. Il protocollo è stato modificato per ridurre al minimo la contaminazione letture di DNA mitocondriale dal 50% al 3% attraverso l'introduzione di un nuovo buffer di lisi.

Tags

ATAC-seq Mitochondrial DNA Contamination CD4+ T Lymphocytes Cell Activation Cell Selection Cell Isolation Cell Counting Magnetic Beads Cell Culture Cell Stimulation

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