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Chapitres
- 00:04Titre
- 01:10Preparation of MALDI Target Plates and Data Acquisition
- 02:02Installing the IDBac Software and Starting with Raw Data
- 02:47Work with Previous Experiments
- 03:22Setting up Protein Data Analysis and Creating Mirror Plots
- 04:07Clustering Samples Using Protein Data
- 04:49Customizing the Protein Dendrogram and Inserting Samples from a Separate Experiment into the Dendrogram
- 05:32Analyzing Specialized Metabolite Data and Metabolite Association Networks (MANs)
- 06:51Results: Analysis of Microbial Protein and Specialized Metabolite Data by IDBac
- 08:28Conclusion
IDBac ist eine Open-Source-Pipeline für Massenspektrometrie, die Daten sowohl aus intakten Proteinen als auch aus spezialisierten Metabolitenspektren integriert, die auf Zellmaterial gesammelt werden, das aus Bakterienkolonien abgekratzt wurde. Die Pipeline ermöglicht es Forschern, schnell Hunderte bis Tausende von Bakterienkolonien in vermeintliche taxonomische Gruppen zu organisieren und sie auf der Grundlage der spezialisierten Metabolitenproduktion weiter zu differenzieren.
