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公司重点调查的社区图书馆筛选确定关键 CTCF 边界
Journal JoVE
Génétique
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HOX Loci Focused CRISPR/sgRNA Library Screening Identifying Critical CTCF Boundaries
DOI:

10:10 min

March 31, 2019

, , , , , ,

Chapitres

  • 00:04Titre
  • 00:49The High Titer sgRNA Library Lentivirus Generation
  • 01:44Titration of Lentiviral Library in MOLM13 Leukemia Cells
  • 02:59Transduction of the Pooled CRISPR-Cas9 KO Library
  • 04:20Screening of the Pooled CRISPR-Cas9 KO Library with One-Step RT-qPCR
  • 05:41Verification of Integrated sgRNAs Positive Clones through Genotyping and Sanger Sequence
  • 06:37Detection of sgRNAs Induced Indel Mutation by Nuclease Digestion Assay
  • 07:48Results: Pooled CRISPR-Cas9 KO Library Screening and Identification
  • 09:19Conclusion

Summary

Traduction automatique

一个 crisprsgrna 文库已被应用于蛋白质编码基因的询问。然而, sgRNA 文库揭示 CTCF 边界在基因调控中的作用的可行性仍未得到探讨。在这里, 我们描述了一个Hox位点特定的 sgRNA 库, 以阐明在hox位点中 ctcf 边界的功能。

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