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HOX Loci Focused CRISPR/SgRNA Bibliothek Screening identifizieren kritische CTCF Grenzen
Journal JoVE
Génétique
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Journal JoVE Génétique
HOX Loci Focused CRISPR/sgRNA Library Screening Identifying Critical CTCF Boundaries
DOI:

10:10 min

March 31, 2019

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Chapitres

  • 00:04Titre
  • 00:49The High Titer sgRNA Library Lentivirus Generation
  • 01:44Titration of Lentiviral Library in MOLM13 Leukemia Cells
  • 02:59Transduction of the Pooled CRISPR-Cas9 KO Library
  • 04:20Screening of the Pooled CRISPR-Cas9 KO Library with One-Step RT-qPCR
  • 05:41Verification of Integrated sgRNAs Positive Clones through Genotyping and Sanger Sequence
  • 06:37Detection of sgRNAs Induced Indel Mutation by Nuclease Digestion Assay
  • 07:48Results: Pooled CRISPR-Cas9 KO Library Screening and Identification
  • 09:19Conclusion

Summary

Traduction automatique

Eine CRISPR/SgRNA-Bibliothek wurde zur Vernehmung Protein-kodierenden Gene angewandt. Die Machbarkeit einer SgRNA Bibliothek um die Funktion einer CTCF Grenze in Genregulation zu entdecken bleibt jedoch unerforscht. Hier beschreiben wir eine HOX Loci spezifische SgRNA Bibliothek um die Funktion von CTCF Grenzen in HOX Loci zu erhellen.

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