Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu. Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Chapitres
- 00:04Titre
- 00:43Validate the Sensitivity and Specificity of Each Primer-probe Set for Each Genomic Barcode Using Digital PCR
- 03:09Analyze Digital PCR Data and Calculate Absolute Copy Numbers
- 04:52Results: Representative Digital PCR Results of Diluted AA-barcoded gDNA
- 06:28Conclusion
Denna molekyl-baserade metod för bestämning av bakteriell kondition underlättar exakt och noggrann detektion av mikroorganismer med hjälp av unika genomiska DNA-streckkoder som kvantifieras via digital PCR. I protokollet beskrivs beräkning av konkurrens index för salmonella stammar. tekniken är dock lätt att anpassa till protokoll som kräver absolut kvantifiering av varje genetiskt formbar organism.
Tags
Digital PCRCompetitive IndexHigh-throughput AnalysisFitnessSalmonellaQuantificationMixed PopulationMolecular-based TechniquesGenetic MarkersBacterial ChromosomesGenomic DNADilution SeriesDigital PCR SupermixProbe-based ChemistryNo Template ControlsNegative ControlsPositive ControlsDroplet GeneratorThermal CyclerData Analysis Software
