Diagnostiska fragmentering filtrering, implementeras i MZmine, är en elegant, efter förvärvet strategi för att skärmen LC-MS/MS dataset för hela klasser av både kända och okända natur produkter. Detta verktyg söker MS/MS-spektra för produkt joner och/eller neutrala förluster som analytikern har definierat som diagnostiskt för hela klassen av föreningar.