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Découverte de produits naturels avec filtrage de fragmentation diagnostique LC-MS/MS: application pour l’analyse microcystine
Journal JoVE
Chimie
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Journal JoVE Chimie
Natural Product Discovery with LC-MS/MS Diagnostic Fragmentation Filtering: Application for Microcystin Analysis
DOI:

07:18 min

May 31, 2019

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Chapitres

  • 00:04Titre
  • 01:04Diagnostic Fragmentation Filtering (DFF) for Microcystin (MC) Analysis
  • 03:37Non-Targeted Liquid Chromatography Tandem Mass Spectrometry (LC-MS/MS) Dataset Preparation
  • 05:25Results: Representative DFF Plot for MC Analysis of M. aeruginosa Cellular Extract
  • 06:45Conclusion

Summary

Traduction automatique

Le filtrage de fragmentation diagnostique, implémenté dans MZmine, est une approche élégante et post-acquisition pour filtrer les jeux de données LC-MS/MS pour des classes entières de produits naturels connus et inconnus. Cet outil recherche les spectres MS/MS pour les ions produits et/ou les pertes neutres que l’analyste a définies comme étant diagnostiques pour l’ensemble de la classe de composés.

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