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Natürliche Produktentdeckung mit LC-MS/MS Diagnostic Fragmentierungs-Filterung: Anwendung für die Mikrocystist-Analyse
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Natural Product Discovery with LC-MS/MS Diagnostic Fragmentation Filtering: Application for Microcystin Analysis
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Natürliche Produktentdeckung mit LC-MS/MS Diagnostic Fragmentierungs-Filterung: Anwendung für die Mikrocystist-Analyse

DOI:
10.3791/59712-v

•

07:18 min

•

May 31, 2019

•

, , , ,
1Department of Chemistry,Carleton University Ottawa, 2London Research and Development Center,Agriculture and Agri-Food Canada

Chapitres

  • 00:04Titre
  • 01:04Diagnostic Fragmentation Filtering (DFF) for Microcystin (MC) Analysis
  • 03:37Non-Targeted Liquid Chromatography Tandem Mass Spectrometry (LC-MS/MS) Dataset Preparation
  • 05:25Results: Representative DFF Plot for MC Analysis of M. aeruginosa Cellular Extract
  • 06:45Conclusion

Summary

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Die in MZmine implementierte Diagnostik-Fragmentierungsfilterung ist ein eleganter, nach der Übernahme eingesetzter Ansatz, um LC-MS/MS-Datensätze für ganze Klassen bekannter und unbekannter Naturprodukte zu überprüfen. Dieses Tool sucht MS/MS-Spektren nach Produkt-Ionen und/oder neutralen Verlusten, die der Analyst als diagnostisch für die gesamte Klasse von Verbindungen definiert hat.

Tags

Natural ProductsDiagnostic Fragmentation FilteringLC-MS/MSMicrocystinCyanobacteriaToxin AnalysisNew Compound DiscoverySoftwareMZmineMass SpectrometryTandem Mass SpectrometrySample Preparation

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