Diagnostisk fragmentering filtrering, implementert i MZmine, er en elegant, post-oppkjøpet tilnærming til skjermen LC-MS/MS datasett for hele klasser av både kjente og ukjente naturlige produkter. Dette verktøyet søker MS/MS Spectra for produktet ioner og/eller nøytrale tap at analytikeren har definert som diagnostiske for hele klassen av forbindelser.