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Analyse comparative des lésions par une approche de séquençage ciblée

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Comparative Lesions Analysis Through a Targeted Sequencing Approach

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Analyse comparative des lésions par une approche de séquençage ciblée

DOI:

10.3791/59844-v

•

08:16 min

•

November 05, 2019

•

Caterina Vicentini, Andrea Mafficini, Michele Simbolo, Matteo Fassan, Pietro Delfino, Rita Teresa Lawlor, Borislav Rusev, Aldo Scarpa², Vincenzo Corbo²

¹ARC-Net Research Centre,University and Hospital Trust of Verona, ²Department of Diagnostics and Public Health, Section of Pathology,University and Hospital Trust of Verona, ³Department of Medicine (DIMED), Surgical Pathology and Cytopathology Unit,University of Padua

Chapitres

00:04Titre
00:48Library Pooling and Sequencing Run
02:28Sample Library Dilution and Loading
03:00Next Generation Sequencing
03:43Mutation and Copy-Number Variation (CNV) Analysis
05:00Somatic Mutation Indexing
05:36Results: Representative Comparative Lesion Analyses
07:16Conclusion

Summary

Traduction automatique

Cet article décrit une méthode pour identifier des altérations clonales et subclonales parmi différents spécimens d'un patient donné. Bien que les expériences décrites ici se concentrent sur un type spécifique de tumeur, l'approche est largement applicable à d'autres tumeurs pleines.

Tags

Keywords: Targeted Sequencing Genetic Relatedness Molecular Alterations Disease Progression Intratumor Heterogeneity Anti-tumor Strategies Solid Tumor Types Sequencing Run Ion Proton System Ion Gene Studio S5 System Ion AmpliSeq 2.0 Library Kit Ion Chef Coverage Analysis Plugin GRCH37HG19 Genome Barcode Set Clonal Amplification Next Generation Sequencing

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