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Analisi comparativa delle lesioni attraverso un approccio di sequenziamento mirato
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Journal JoVE Sciences du comportement
Comparative Lesions Analysis Through a Targeted Sequencing Approach
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Analisi comparativa delle lesioni attraverso un approccio di sequenziamento mirato

DOI:
10.3791/59844-v

•

08:16 min

•

November 05, 2019

•

, , , , , , , ,
1ARC-Net Research Centre,University and Hospital Trust of Verona, 2Department of Diagnostics and Public Health, Section of Pathology,University and Hospital Trust of Verona, 3Department of Medicine (DIMED), Surgical Pathology and Cytopathology Unit,University of Padua

Chapitres

  • 00:04Titre
  • 00:48Library Pooling and Sequencing Run
  • 02:28Sample Library Dilution and Loading
  • 03:00Next Generation Sequencing
  • 03:43Mutation and Copy-Number Variation (CNV) Analysis
  • 05:00Somatic Mutation Indexing
  • 05:36Results: Representative Comparative Lesion Analyses
  • 07:16Conclusion

Summary

Traduction automatique

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Questo articolo descrive un metodo per identificare le alterazioni clonali e subclonali tra campioni diversi di un determinato paziente. Anche se gli esperimenti qui descritti si concentrano su un tipo di tumore specifico, l'approccio è ampiamente applicabile ad altri tumori solidi.

Tags

Targeted SequencingGenetic RelatednessMolecular AlterationsDisease ProgressionIntratumor HeterogeneityAnti-tumor StrategiesSolid Tumor TypesSequencing RunIon Proton SystemIon Gene Studio S5 SystemIon AmpliSeq 2.0 Library KitIon ChefCoverage Analysis PluginGRCH37HG19 GenomeBarcode SetClonal AmplificationNext Generation Sequencing

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