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Rilevamento oncogenico della fusione genica utilizzando la reazione della catena di polimerasi multiplex ancorata seguita dal sequenziamento di nuova generazione
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Oncogenic Gene Fusion Detection Using Anchored Multiplex Polymerase Chain Reaction Followed by Next Generation Sequencing
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Rilevamento oncogenico della fusione genica utilizzando la reazione della catena di polimerasi multiplex ancorata seguita dal sequenziamento di nuova generazione

DOI:
10.3791/59895-v

•

09:49 min

•

July 05, 2019

•

, ,
1Department of Pathology,University of Colorado – Anschutz Medical Campus

Chapitres

  • 00:04Titre
  • 00:49Random Priming and First Strand cDNA Synthesis
  • 01:55Ligation Step 2 and Bead Purification
  • 04:25First PCR and Bead Purification
  • 05:48Library Quantitation and Sequencing
  • 07:41Assay Data Interpretation
  • 08:39Results: Sample Summary and Fusion Calls
  • 09:27Conclusion

Summary

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Questo articolo descrive in dettaglio l'uso di un kit di preparazione della libreria a catena di reazione a catena multiplea Vengono descritte entrambe le fasi di analisi wet-bench e dei dati.

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Keywords: Gene Fusion DetectionAnchored Multiplex PCRNext-generation SequencingOncogenic Gene FusionsTumor SamplesFormulative FixationDiagnosisPrognosisTreatment SelectionArtifactsRandom PrimingFirst Strand CDNA SynthesisSecond Strand CDNA SynthesisBead PurificationMolecular Barcode Adapter

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