Journal
/
Recherche en cancérologie
/
Kreftfremkallende Gene Fusion Detection bruke forankret multiplex polymerase Kjedere reaksjon etterfulgt av neste generasjon sekvensering
Journal JoVE
Recherche en cancérologie
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Journal JoVE Recherche en cancérologie
Oncogenic Gene Fusion Detection Using Anchored Multiplex Polymerase Chain Reaction Followed by Next Generation Sequencing

Kreftfremkallende Gene Fusion Detection bruke forankret multiplex polymerase Kjedere reaksjon etterfulgt av neste generasjon sekvensering

DOI:
10.3791/59895-v

•

09:49 min

•

July 05, 2019

•

, ,
1Department of Pathology,University of Colorado – Anschutz Medical Campus

Chapitres

  • 00:04Titre
  • 00:49Random Priming and First Strand cDNA Synthesis
  • 01:55Ligation Step 2 and Bead Purification
  • 04:25First PCR and Bead Purification
  • 05:48Library Quantitation and Sequencing
  • 07:41Assay Data Interpretation
  • 08:39Results: Sample Summary and Fusion Calls
  • 09:27Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Denne artikkelen detaljer bruk av en forankret multiplex polymerase kjede reaksjon-basert bibliotek forberedelse Kit etterfulgt av neste generasjons sekvensering å vurdere for kreftfremkallende gen fusjoner i kliniske solide tumor prøver. Fremgangsmåten for både våt benk og dataanalyse beskrives.

Tags

Keywords: Gene Fusion DetectionAnchored Multiplex PCRNext-generation SequencingOncogenic Gene FusionsTumor SamplesFormulative FixationDiagnosisPrognosisTreatment SelectionArtifactsRandom PrimingFirst Strand CDNA SynthesisSecond Strand CDNA SynthesisBead PurificationMolecular Barcode Adapter

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

check_url/fr/59895?article_type=v

Next Generation Sequencing for påvisning av Actionable mutasjoner i faste og flytende Svulster
check_url/fr/59895?article_type=v

Påvisning av sjeldne mutasjoner i CtDNA med neste generasjons sekvensering
check_url/fr/59895?article_type=v

Leter Driver veier av ervervet motstand mot målrettet terapi: resistente Subclone generasjon og følsomhet gjenoppretting av Gene sammenleggbare
check_url/fr/59895?article_type=v

Bruker CRISPR/Cas9 Gene redigering for å undersøke kreftfremkallende aktiviteten av muterte Calreticulin i cytokin avhengige blodkreft cellene
check_url/fr/59895?article_type=v

Digital Polymerase kjedereaksjon analysen for den genetisk variasjonen i en sporadisk familiær adenomatøse polypose pasient i Chip-i-en-t-format
check_url/fr/59895?article_type=v

Dråpe Digital TRAP (ddTRAP): tilpasning av telomere gjenta forsterkning protokoll til dråpe Digital polymerase Kjedere reaksjon
check_url/fr/59895?article_type=v

Kartlegging av strukturfunksjonsrelasjoner av uordnede onkogene transkripsjonsfaktorer ved hjelp av transkripsjonsanalyse
check_url/fr/59895?article_type=v

In Vitro evaluering av onkogen transformasjon i humane pattedyr epitelceller
check_url/fr/59895?article_type=v

Romlig profilering av protein- og RNA-uttrykk i vev: En tilnærming til finjustering av virtuell mikrodisseksjon
check_url/fr/59895?article_type=v

Transmitochondrial cybrid generasjon ved hjelp av kreftcellelinjer

Read Article