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Analyse du microbiote à l'aide de PCR en deux étapes et de la prochaine génération 16S rRNA Gene Sequencing
Journal JoVE
Biologie
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Journal JoVE Biologie
Microbiota Analysis Using Two-step PCR and Next-generation 16S rRNA Gene Sequencing
DOI:

11:22 min

October 15, 2019

, , ,

Chapitres

  • 00:04Titre
  • 01:25Extraction of DNA from Fecal Sample
  • 02:2916S rRNA Gene Amplification (PCR1) and DNA Library Construction (PCR2)
  • 03:57Clean-up of Indexed PCR (PCR2) and Quantification
  • 06:03Sequence Analysis
  • 07:49Results: Quality Profile and Statistical Analysis
  • 09:29Conclusion

Summary

Traduction automatique

Décrit ici est une procédure d'exploitation standard simplifiée pour le profilage de microbiome utilisant le séquençage et l'analyse ménomiques rRNA 16S utilisant des outils librement disponibles. Ce protocole aidera les chercheurs qui sont nouveaux dans le domaine du microbiome ainsi que ceux qui ont besoin de mises à jour sur les méthodes pour atteindre le profilage bactérien à une résolution plus élevée.

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