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Mikrobiota-Analyse mit zweistufiger PCR- und 16S-rRNA-Gensequenzierung der nächsten Generation
Journal JoVE
Biologie
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Journal JoVE Biologie
Microbiota Analysis Using Two-step PCR and Next-generation 16S rRNA Gene Sequencing
DOI:

11:22 min

October 15, 2019

, , ,

Chapitres

  • 00:04Titre
  • 01:25Extraction of DNA from Fecal Sample
  • 02:2916S rRNA Gene Amplification (PCR1) and DNA Library Construction (PCR2)
  • 03:57Clean-up of Indexed PCR (PCR2) and Quantification
  • 06:03Sequence Analysis
  • 07:49Results: Quality Profile and Statistical Analysis
  • 09:29Conclusion

Summary

Traduction automatique

Hier wird ein vereinfachtes Standard-Betriebsverfahren für die Mikrobiom-Profilierung mit 16S rRNA metagenomischer Sequenzierung und Analyse mit frei verfügbaren Werkzeugen beschrieben. Dieses Protokoll wird Forschern helfen, die neu im Mikrobiom-Bereich sind, sowie solchen, die Aktualisierungen von Methoden benötigen, um bakterielleS Profiling mit einer höheren Auflösung zu erreichen.

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