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Verbesserung der kleinen RNA-Seq: Weniger Voreingenommenheit und bessere Detektion von 2'-O-Methyl RNAs
Journal JoVE
Génétique
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Journal JoVE Génétique
Improving Small RNA-seq: Less Bias and Better Detection of 2′-O-Methyl RNAs
DOI:

08:49 min

September 16, 2019

, ,

Chapitres

  • 00:04Titre
  • 00:33Small RNA Isolation
  • 02:26Unligated 3’ Adapter Elimination
  • 04:41Gel Purification
  • 05:27Raw Sequence File Treatment
  • 06:06Trimmed Sequence Mapping
  • 06:58Results: Representative 2’-OMe RNA Detection
  • 08:18Conclusion

Summary

Traduction automatique

Wir präsentieren ein detailliertes reparaturbasiertes Analyseprotokoll für kleine RNA-Bibliotheken mit weniger Voreingenommenheit als Standardmethoden und einer erhöhten Empfindlichkeit für 2'-O-Methyl-RNAs. Dieses Protokoll kann mit hausgemachten Reagenzien befolgt werden, um Kosten zu sparen oder Kits für die Bequemlichkeit zu verwenden.

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