Journal
/
Génétique
/
Kartlegging Alzheimers sykdom varianter til deres mål gener bruke beregningsorientert analyse av Kromatin Configuration
Journal JoVE
Génétique
This content is Free Access.
Journal JoVE Génétique
Mapping Alzheimer’s Disease Variants to Their Target Genes Using Computational Analysis of Chromatin Configuration

Kartlegging Alzheimers sykdom varianter til deres mål gener bruke beregningsorientert analyse av Kromatin Configuration

DOI:
10.3791/60428-v

•

04:41 min

•

January 09, 2020

•

, , ,
1Department of Genetics,University of North Carolina, 2Neuroscience Center,University of North Carolina, 3Thurston Arthritis Research Center,University of North Carolina, 4Department of Cell Biology and Physiology,University of North Carolina

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 01:00Generation of a Granges Object for Credible SNPs and Positional Mapping
  • 01:53Developmental Expression Trajectories
  • 02:18Cell-type Expression Profiles and Gene Annotation Enrichment Analysis
  • 02:46Results: Determination and Characterization of Putative Target Genes of AD GWS Loci
  • 03:52Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Vi presenterer en protokoll for å identifisere funksjonelle implikasjoner av ikke-koding varianter identifisert av Genova-brede foreningen studier (GWAS) ved hjelp av tredimensjonale kromatin interaksjoner.

Tags

Keywords: Alzheimer’s DiseaseGWASChromatin ConfigurationComputational AnalysisTarget GenesSNPsHi-CGene ExpressionCell-type ExpressionGene Annotation Enrichment

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

check_url/fr/60428?article_type=v

Kartlegging av RNA-RNA-interaksjoner globalt ved bruk av biotinylert psoralen
check_url/fr/60428?article_type=v

Sekvensiell Salt utdrag for analyse av Bulk Chromatin bindende egenskaper Chromatin endre komplekser
check_url/fr/60428?article_type=v

Analyse av c-KIT ligand-promotoren ved bruk av kromatinimmunutfelling
check_url/fr/60428?article_type=v

Retroviral skanning: Mapping MLV Integrering Sites for å definere Cell-spesifikke Regulatory Regioner
check_url/fr/60428?article_type=v

Kartlegging genomet hele tilgjengelig Chromatin i primære menneskelige T-lymfocytter av ATAC-Seq
check_url/fr/60428?article_type=v

Immunostaining for DNA modifikasjoner: beregningsorientert analyse av AC Confocal bilder
check_url/fr/60428?article_type=v

Bruke Sniper-Cas9 å minimere Off-målet effekter av CRISPR-Cas9 uten tap av på målet aktivitet Via regissert evolusjon
check_url/fr/60428?article_type=v

En in vitro-protokoll for evaluering av MicroRNA nivåer, funksjoner og assosierte mål gener i tumor celler
check_url/fr/60428?article_type=v

In vivo funksjonell studie av sykdom-Associated sjeldne Human varianter bruke Drosophila
check_url/fr/60428?article_type=v

Identifikasjon av sirkulær RNAs ved hjelp av RNA-sekvensering

Read Article