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质谱导览基因组挖掘作为发现新天然产品的工具

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Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products

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质谱导览基因组挖掘作为发现新天然产品的工具

DOI:

10.3791/60825-v

•

11:13 min

•

March 12, 2020

•

Renata Sigrist, Bruno S. Paulo, Célio F. F. Angolini, Luciana G. De Oliveira

¹Department of Organic Chemistry, Institute of Chemistry,University of Campinas (UNICAMP), ²Center for Natural and Human Sciences,Federal University of ABC (UFABC)

Chapitres

00:04Introduction
02:54Genome Mining for Biosynthetic Gene Clusters
03:46Strain Cultivation
04:51Acquiring Mass Spectra and Preparation for GNPS Analysis
05:43GNPS Analysis
08:33Results: Genome Sequence Analysis and Molecular Networking
09:46Conclusion

Summary

Traduction automatique

这里建立了一个质谱仪指导基因组挖掘协议并对此进行描述。它基于基因组序列信息和LC-MS/MS分析，旨在促进从复杂的微生物和植物提取物的分子的识别。

Tags

Keywords: Mass Spectrometry Genome Mining Natural Product Discovery Molecular Networking Whole Genome Sequencing Genotype-to-chemotype Biosynthetic Clusters Secondary Metabolism GNPS Streptomyces Fungi Plants

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